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Santé digestive — Avita Serena
Blog · Santé digestive
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SII ou SIBO :
comprendre la différence

Sabrina Castelli · Naturopathe Juin 2026

Derrière des symptômes digestifs chroniques — ballonnements, transit instable, douleurs abdominales postprandiales — se cachent deux réalités physiologiques distinctes que les approches génériques confondent trop souvent. Identifier laquelle est en jeu change radicalement l’angle de travail.

Le Syndrome de l’Intestin Irritable : un trouble fonctionnel du côlon

Le SII, anciennement désigné sous le terme de colopathie fonctionnelle, est un trouble qui implique le gros intestin. Il se caractérise par une hypersensibilité viscérale — le seuil de perception des contractions intestinales est abaissé — associée à des perturbations de la motricité colique et à une micro-inflammation de faible intensité de la muqueuse. C’est une condition dans laquelle l’axe intestin-cerveau joue un rôle central. Toute perturbation de cet axe — stress chronique, antécédent infectieux, dysbiose — peut entretenir ou amplifier les symptômes. Le diagnostic de SII est un diagnostic d’exclusion posé sur critères cliniques (Rome IV).

Données épidémiologiques

Le SII touche entre 10 et 15 % de la population mondiale adulte, avec une prédominance féminine. Jusqu’à 78 % des patients répondant aux critères du SII présenteraient également un SIBO (Pimentel et al., 2000 ; Ghoshal et al., 2017).

Le SIBO : une question de localisation, pas de sensibilité

Le SIBO (Small Intestinal Bacterial Overgrowth) est d’une nature différente. Il ne s’agit pas d’un trouble de la sensibilité, mais d’un déplacement et d’une prolifération de bactéries dans un territoire qui devrait en être quasiment dépourvu. Ces bactéries fermentent prématurément les glucides dans l’intestin grêle, produisant des gaz — H₂, CH₄ ou H₂S — avec des conséquences directes sur l’absorption des nutriments et l’intégrité de la muqueuse.

Le SIBO n’est pas une maladie en soi : c’est le reflet d’un ou plusieurs mécanismes de protection de l’intestin grêle qui ont défailli — motilité, acidité gastrique, valvule iléo-cæcale, immunité locale.

Tableau comparatif : SII vs SIBO

CritèreSIISIBO
LocalisationCôlonIntestin grêle
Mécanisme centralHypersensibilité viscérale, axe intestin-cerveauProlifération bactérienne, fermentation prématurée
Timing des symptômesVariable, lié au stressDans les 90 min suivant le repas
DiagnosticClinique (exclusion)Test respiratoire H₂/CH₄

Un tableau clinique qui se superpose souvent

SIBO et SII coexistent fréquemment, ce qui explique pourquoi tant de personnes diagnostiquées SII ne répondent pas aux approches standard : si la composante SIBO n’est pas identifiée, le travail sur le côlon seul restera partiel. Les deux conditions partagent des facteurs favorisants communs — stress chronique, antécédents infectieux, prise prolongée d’IPP, perturbations hormonales.

Pourquoi une approche globale est nécessaire

Certaines approches diététiques courantes peuvent aggraver un SIBO non identifié. Certains substrats fermentescibles, bénéfiques pour le microbiote colique, constituent précisément le carburant de la prolifération dans l’intestin grêle. L’identification préalable du tableau prédominant conditionne la logique d’ensemble du suivi.

Note de l’auteure : Cet article est rédigé à titre informatif et éducatif. Il ne se substitue pas à un avis médical ni à une consultation spécialisée.

Sources scientifiques
Pimentel M, Chow EJ, Lin HC. Eradication of small intestinal bacterial overgrowth reduces symptoms of irritable bowel syndrome. Am J Gastroenterol, 2000 ; 95(12) : 3503-3506.
Ghoshal UC, Shukla R, Ghoshal U. Small Intestinal Bacterial Overgrowth and Irritable Bowel Syndrome. Gut and Liver, 2017 ; 11(2) : 196-208.
Lacy BE, et al. Bowel Disorders. Gastroenterology, 2016 ; 150(6) : 1393-1407. [Critères Rome IV]
Pimentel M, et al. ACG Clinical Guideline: Small Intestinal Bacterial Overgrowth. Am J Gastroenterol, 2020 ; 115(2) : 165-178.
Avertissement : Les informations contenues dans cet article sont fournies à titre éducatif et informatif uniquement. Elles ne constituent pas un diagnostic médical, un avis thérapeutique ou une recommandation de traitement. Toute démarche de santé doit être conduite sous la supervision d’un médecin ou d’un professionnel de santé qualifié.